隨著基因技術(shù)的不斷發(fā)展,基因測序領(lǐng)域逐漸迎來了越來越多的可能。2012年,美國和瑞典的科學(xué)家共同開發(fā)了一種具有里程碑意義的新型單細(xì)胞測序技術(shù)Smart-seq,將單細(xì)胞的mRNA測序帶入了新階段。這一年,安諾優(yōu)達(dá)在北京成立,吸納了一群胸懷抱負(fù)的科研人員,沖刺在包含單細(xì)胞測序在內(nèi)的新一代基因組學(xué)技術(shù)領(lǐng)域的前沿,開啟了“用科技和創(chuàng)新提升生命品質(zhì)”的求索。
基因行業(yè)將步入怎樣的發(fā)展時(shí)代?哪些技術(shù)將引 ling 行業(yè)發(fā)展?在“安諾優(yōu)達(dá)基因測序應(yīng)用創(chuàng)新大會(huì)暨DNBSEQ-T7平臺(tái)單細(xì)胞和Hi-C文庫測序新品發(fā)布會(huì)”上,生物探索就這些問題采訪了安諾優(yōu)達(dá)科技服務(wù)營銷中心總經(jīng)理裴素蕊博士。
聚焦jian端技術(shù),助推科研及人類健康事業(yè)發(fā)展
毋庸置疑,技術(shù)的進(jìn)步是支撐基因檢測行業(yè)向前邁步的關(guān)鍵。當(dāng)前,高通量染色體構(gòu)象捕獲測序(Hi-C)及單細(xì)胞測序是基因檢測領(lǐng)域炙手可熱的技術(shù)之一。作為遺傳學(xué)領(lǐng)域的優(yōu)秀服務(wù)提供商,安諾優(yōu)達(dá)自成立以來便是新一代基因組學(xué)技術(shù)的洞察者與積極者,在單細(xì)胞測序技術(shù)以及Hi-C技術(shù)均有布局,這兩個(gè)熱門領(lǐng)域后來也成為安諾優(yōu)達(dá)掌握的核心技術(shù)之一。
談及單細(xì)胞測序技術(shù),裴素蕊博士認(rèn)為,這不僅是細(xì)胞層級研究上的推進(jìn),更讓生命科學(xué)研究向前邁進(jìn)了一大步。“得益于單細(xì)胞技術(shù)的發(fā)展,我們能夠看到細(xì)胞之間的差異,而這種異質(zhì)性往往會(huì)對多細(xì)胞生物的功能產(chǎn)生深遠(yuǎn)影響,是了解疾病發(fā)生和發(fā)展的重要切入口。一些企業(yè)已經(jīng)使用單細(xì)胞測序技術(shù)進(jìn)行腫瘤Marker的篩選,不僅僅是腫瘤治療,在生殖生育、免疫學(xué)等領(lǐng)域,單細(xì)胞測序同樣大有可為。”
關(guān)于Hi-C技術(shù),裴素蕊博士表示:“實(shí)際上當(dāng)前的研究是借助該技術(shù)了解DNA在細(xì)胞核中的空間結(jié)構(gòu),了解DNA在空間組學(xué)上的變化與基因表達(dá)、性狀表達(dá)乃至疾病發(fā)生之間的關(guān)聯(lián)。人體DNA拉平后大約有兩米長,經(jīng)過各種折疊存在于一個(gè)幾微米的細(xì)胞核中,而DNA的折疊會(huì)影響表型的發(fā)生,甚至與一些疾病具有直接的關(guān)聯(lián)。就像是一個(gè)毛線球,我們用手抓取之后它的線條形狀就會(huì)發(fā)生變化。這些變化會(huì)產(chǎn)生什么影響呢?這就是我們通過Hi-C技術(shù)可以去研究的問題。”
在基因行業(yè)中,單細(xì)胞測序技術(shù)與Hi-C測序技術(shù)分別扮演著怎樣的角色?對于這個(gè)問題,裴素蕊博士也向生物探索表達(dá)了自己的見解:“單細(xì)胞測序技術(shù)是行業(yè)發(fā)展的助推器,當(dāng)前許多無法解決的問題或許能在單細(xì)胞上找到切入口,應(yīng)用范圍十分廣泛;而Hi-C技術(shù)目前更多地用于jian端領(lǐng)域的探索,距離在醫(yī)學(xué)或生物學(xué)領(lǐng)域內(nèi)產(chǎn)生實(shí)際應(yīng)用價(jià)值,仍然有很長的路要走,當(dāng)然,我們可以保持一定的想象力,或許在未來的某一個(gè)時(shí)間節(jié)點(diǎn)上,Hi-C技術(shù)會(huì)大放異彩、走向臨床。”
緊隨行業(yè)新趨勢,空間、動(dòng)態(tài)基因組時(shí)代可期
2020年9月,安諾優(yōu)達(dá)引入了華大智造自主研發(fā)的全球日生產(chǎn)能力*的基因測序儀DNBSEQ-T7,在不到一年的時(shí)間里,便成功開發(fā)出基于該平臺(tái)的單細(xì)胞文庫和Hi-C文庫測序。從現(xiàn)有數(shù)據(jù)來看,單細(xì)胞測序、Hi-C測序與DNBSEQ-T7平臺(tái)的結(jié)合產(chǎn)生了“1+1>2”的效果。
此次采訪中,裴素蕊博士進(jìn)一步分享了這一結(jié)合帶給她的驚喜與觸動(dòng):“在DNBSEQ-T7平臺(tái)上,單細(xì)胞和Hi-C文庫的*優(yōu)勢得到了充分的發(fā)揮。從單細(xì)胞測序的角度來說,通過DNBSEQ-T7平臺(tái)獲得的基因組比對率達(dá)到95%以上。在Hi-C方面,數(shù)據(jù)更令人欣喜。在安諾優(yōu)達(dá)推出該技術(shù)的5年間,所獲得的有效數(shù)據(jù)比例在60%到85%之間,而在DNBSEQ-T7平臺(tái)數(shù)據(jù)有效性能達(dá)到驚人的90%以上。”
至于單細(xì)胞和Hi-C文庫與DNBSEQ-T7平臺(tái)的結(jié)合為科研帶來的影響,裴素蕊博士認(rèn)為或?qū)Ⅲw現(xiàn)在3方面:首先是數(shù)據(jù)的可用性和有效性的大幅度提升,其次是隨著有效性數(shù)據(jù)增加帶來成本的下降,再者是不同平臺(tái)數(shù)據(jù)的一致性方面有所保障。
在單細(xì)胞和Hi-C等技術(shù)的加持下,基因組學(xué)研究已經(jīng)步入了新的發(fā)展時(shí)代。未來,基因組學(xué)研究又將迎來怎樣的發(fā)展?對此,裴素蕊博士表示,一個(gè)可預(yù)見的趨勢是動(dòng)態(tài)研究時(shí)代的到來。
“目前基因組研究已經(jīng)開始實(shí)現(xiàn)從線性到三維、從整體到個(gè)體的跨越,未來,我們一定會(huì)迎來基因組學(xué)動(dòng)態(tài)研究的時(shí)代。這個(gè)概念最早是在美國被提出,有一個(gè)專業(yè)術(shù)語叫做‘4D基因組’?,F(xiàn)階段的基因組學(xué)研究是了解某一個(gè)時(shí)間節(jié)點(diǎn)上細(xì)胞的變化,而動(dòng)態(tài)研究則是探究在某一段時(shí)期內(nèi)的變化。除靜態(tài)到動(dòng)態(tài)的變化外,從平面研究轉(zhuǎn)向空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)甚至空間表觀組學(xué)也是值得我們關(guān)注的重要趨勢。這些變化是可以期待的,在不遠(yuǎn)的未來一定會(huì)變成現(xiàn)實(shí),我們已經(jīng)在這些領(lǐng)域展開了布局。” 裴素蕊博士如是說道。
步入快車道,未來發(fā)展或不亞于互聯(lián)網(wǎng)行業(yè)
近年來,我國基因測序產(chǎn)業(yè)正步入快車道。根據(jù)中國首屆“NGS(新一代基因測序)行業(yè)峰會(huì)”公布的數(shù)據(jù),2020年我國基因檢測企業(yè)在一級市場中所獲融資達(dá)到193億元,較2019年增長了153%,并且增速持續(xù)上升。
提及基因檢測行業(yè)的未來發(fā)展,裴素蕊博士深信,基因檢測行業(yè)未來前景光明。
“無論是上市企業(yè)、資本,還是領(lǐng)域內(nèi)的科研人員,大家之所以進(jìn)入這個(gè)行業(yè)很大程度上是因?yàn)榉浅?春么蠼】敌袠I(yè)的未來,而基因檢測是大健康領(lǐng)域的翹楚。隨著不同的技術(shù)和企業(yè)不斷涌入,基因檢測行業(yè)會(huì)呈現(xiàn)出百花齊放、百家爭鳴的狀態(tài)。在這個(gè)過程中,一些企業(yè)將被淘汰出局,但無疑也會(huì)有技術(shù)和公司脫穎而出,為人類健康帶來深遠(yuǎn)的影響,推動(dòng)基因檢測行業(yè)發(fā)展為不亞于互聯(lián)網(wǎng)的大健康行業(yè)。”
當(dāng)然,基因檢測行業(yè)尚處于野蠻生長時(shí)期,仍然存在一些問題亟待解決。對此,裴素蕊博士從上游精密儀器的供應(yīng)、行業(yè)規(guī)范指南的空缺以及人才資源的匱乏三方面進(jìn)行了分析。
“從國內(nèi)基因檢測企業(yè)的角度來說,目前我們的發(fā)展一定程度上受制于國外供應(yīng)商,或者說國外的單一供應(yīng)商,而國際關(guān)系又復(fù)雜多變,這些因素對于行業(yè)發(fā)展而言極為不利,期待今后能夠有更多國產(chǎn)測序企業(yè)破局。再者,當(dāng)前基因檢測領(lǐng)域仍然缺乏完整的規(guī)范指南,當(dāng)然這并非是我國的問題,而是基因行業(yè)在野蠻生長過程中必然會(huì)面臨的問題,這個(gè)問題的解決需要相關(guān)部門與企業(yè)開展更多交流。另外,基因領(lǐng)域人才的匱乏也是阻礙行業(yè)發(fā)展的重要因素,未來希望能夠有更多人了解基因行業(yè),并加入到這個(gè)行業(yè)中來。”
如今,基因技術(shù)正以勢不可擋之勢在臨床和科研領(lǐng)域“開疆拓土”。在科學(xué)技術(shù)的發(fā)展日新月異的今天,或許很難預(yù)測未來基因測序技術(shù)的下一個(gè)風(fēng)口。但誠如裴素蕊博士所言,在如今這個(gè)時(shí)代,科研人員的想象力尤為重要,這是將不可能變?yōu)榭赡艿膭?dòng)力源泉。
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來源:生物探索
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